Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF12Q96QT6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms