Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms