Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ATRIPQ8WXE1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms