Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00612Q8N6U2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00612Q8N6U2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms