Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPP4R4Q6NUP7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP4R4Q6NUP7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms