Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38BQ5VTL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF38BQ5VTL8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF38BQ5VTL8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms