Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDK2Q58EX2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDK2Q58EX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms