Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCTN1Q2MV58 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCTN1Q2MV58 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TCTN1Q2MV58 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCTN1Q2MV58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCTN1Q2MV58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCTN1Q2MV58 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCTN1Q2MV58 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCTN1Q2MV58 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCTN1Q2MV58 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms