Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIF1AQ16665 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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