Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNCBQ16143 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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