Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD1Q15797 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD1Q15797 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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