Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPARCL1Q14515 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPARCL1Q14515 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPARCL1Q14515 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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