Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL1Q13616 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL1Q13616 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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