Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 BUD28YLR062C 378 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 ATP14YLR295C 375 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 TRM10YOL093W 882 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 CKB2YOR039W 777 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 SCP1YOR367W 603 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 MPH2YDL247W 1830 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 ROT2YBR229C 2865 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 HRK1YOR267C 2280 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 MCH4YOL119C 1506 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 UBX7YBR273C 1311 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 CNL1YDR357C 369 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 THI5YFL058W 1023 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 THI12YNL332W 1023 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 ZPS1YOL154W 750 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 SER1YOR184W 1188 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 MET31YPL038W 534 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 TOM5YPR133W-A 153 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 BUD22YMR014W 1560 nt4.26□□□□□ -1.73
USB1Q12208 HUL4YJR036C 2679 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 SLC1YDL052C 912 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 TRS23YDR246W 660 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 RPN12YFR052W 825 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 ZRT1YGL255W 1131 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 MTC1YJL123C 1437 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 FMP33YJL161W 543 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 SAC1YKL212W 1872 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 PRE7YBL041W 726 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 YMR245WYMR245W 621 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 QCR2YPR191W 1107 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 BLM10YFL007W 6432 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 YGR125WYGR125W 3111 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 UBP7YIL156W 3216 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 JEM1YJL073W 1938 nt4.25□□□□□ -1.73
USB1Q12208 PAN1YIR006C 4443 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 MSH1YHR120W 2880 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 YGR266WYGR266W 2106 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 CBT1YKL208W 816 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 YLR283WYLR283W 945 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 PDR15YDR406W 4590 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 SEG2YKL105C 3399 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 GRS1YBR121C 2004 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 RSC6YCR052W 1452 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 FAP1YNL023C 2898 nt4.24□□□□□ -1.73
USB1Q12208 NPL6YMR091C 1308 nt4.23□□□□□ -1.73
USB1Q12208 PTR2YKR093W 1806 nt4.23□□□□□ -1.73
USB1Q12208 GCN20YFR009W 2259 nt4.23□□□□□ -1.73
USB1Q12208 MNN10YDR245W 1182 nt4.23□□□□□ -1.73
USB1Q12208 LCP5YER127W 1074 nt4.23□□□□□ -1.73
USB1Q12208 LCB2YDR062W 1686 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 MET3YJR010W 1536 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 ATR1YML116W 1629 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 LHP1YDL051W 828 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 LUC7YDL087C 786 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 UPS3YDR185C 540 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 HPM1YIL110W 1134 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 HAL1YPR005C 885 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 UGA2YBR006W 1494 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 NNK1YKL171W 2787 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 PMT5YDL093W 2232 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 SED4YCR067C 3198 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 HFA1YMR207C 6372 nt4.22□□□□□ -1.73
USB1Q12208 BGL2YGR282C 942 nt4.21□□□□□ -1.74
USB1Q12208 CBP1YJL209W 1965 nt4.21□□□□□ -1.74
USB1Q12208 STE7YDL159W 1548 nt4.21□□□□□ -1.74
USB1Q12208 RCK1YGL158W 1539 nt4.21□□□□□ -1.74
USB1Q12208 IMD3YLR432W 1572 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 TUB2YFL037W 1374 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YDR417CYDR417C 372 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 ACT1YFL039C 1128 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 TLG2YOL018C 1194 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 BUB3YOR026W 1026 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 CUE5YOR042W 1236 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 NAT5YOR253W 531 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 OPY2YPR075C 1083 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 HXT4YHR092C 1731 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YMR102CYMR102C 2505 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 COT1YOR316C 1320 nt4.2□□□□□ -1.74
USB1Q12208 FAU1YER183C 636 nt4.19□□□□□ -1.74
USB1Q12208 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.19□□□□□ -1.74
USB1Q12208 RMI1YPL024W 726 nt4.19□□□□□ -1.74
USB1Q12208 SIF2YBR103W 1608 nt4.19□□□□□ -1.74
USB1Q12208 STB2YMR053C 2553 nt4.19□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YBR139WYBR139W 1527 nt4.19□□□□□ -1.74
USB1Q12208 SBE2YDR351W 2595 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 ESF1YDR365C 1887 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 MDM34YGL219C 1380 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 FRE7YOL152W 1863 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 MKS1YNL076W 1755 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 ALD3YMR169C 1521 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 ALD2YMR170C 1521 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YEL067CYEL067C 588 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YNL174WYNL174W 573 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 snR10snR10 245 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YCL012CYCL012C 405 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 CTT1YGR088W 1689 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YMR196WYMR196W 3267 nt4.18□□□□□ -1.74
USB1Q12208 MMT2YPL224C 1455 nt4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.7 ms