Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPS35P82673 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS35P82673 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms