Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP107P57740 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP107P57740 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP107P57740 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP107P57740 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP107P57740 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP107P57740 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP107P57740 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP107P57740 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP107P57740 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP107P57740 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP107P57740 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP107P57740 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP107P57740 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP107P57740 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP107P57740 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP107P57740 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP107P57740 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP107P57740 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP107P57740 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP107P57740 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP107P57740 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP107P57740 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP107P57740 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP107P57740 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP107P57740 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP107P57740 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP107P57740 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP107P57740 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP107P57740 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP107P57740 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP107P57740 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP107P57740 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP107P57740 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms