Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMP3P54852 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMP3P54852 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMP3P54852 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMP3P54852 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMP3P54852 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMP3P54852 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMP3P54852 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMP3P54852 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMP3P54852 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMP3P54852 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMP3P54852 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMP3P54852 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMP3P54852 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMP3P54852 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMP3P54852 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMP3P54852 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMP3P54852 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMP3P54852 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMP3P54852 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMP3P54852 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMP3P54852 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMP3P54852 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMP3P54852 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMP3P54852 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMP3P54852 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMP3P54852 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMP3P54852 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMP3P54852 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMP3P54852 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMP3P54852 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMP3P54852 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMP3P54852 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMP3P54852 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMP3P54852 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMP3P54852 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMP3P54852 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMP3P54852 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMP3P54852 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMP3P54852 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMP3P54852 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMP3P54852 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EMP3P54852 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMP3P54852 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMP3P54852 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMP3P54852 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMP3P54852 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms