Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS1P54277 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS1P54277 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS1P54277 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS1P54277 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS1P54277 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS1P54277 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS1P54277 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS1P54277 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS1P54277 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS1P54277 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS1P54277 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS1P54277 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS1P54277 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS1P54277 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS1P54277 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS1P54277 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS1P54277 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PMS1P54277 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS1P54277 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS1P54277 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS1P54277 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS1P54277 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS1P54277 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS1P54277 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS1P54277 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS1P54277 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS1P54277 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS1P54277 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS1P54277 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS1P54277 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS1P54277 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS1P54277 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS1P54277 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS1P54277 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS1P54277 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS1P54277 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS1P54277 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms