Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCP4P48539 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCP4P48539 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCP4P48539 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCP4P48539 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCP4P48539 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCP4P48539 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCP4P48539 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCP4P48539 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCP4P48539 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCP4P48539 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCP4P48539 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCP4P48539 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCP4P48539 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCP4P48539 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCP4P48539 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCP4P48539 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCP4P48539 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCP4P48539 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCP4P48539 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCP4P48539 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCP4P48539 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCP4P48539 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCP4P48539 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCP4P48539 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCP4P48539 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCP4P48539 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCP4P48539 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCP4P48539 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCP4P48539 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCP4P48539 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms