Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP2P46087 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP2P46087 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOP2P46087 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP2P46087 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP2P46087 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP2P46087 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP2P46087 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP2P46087 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP2P46087 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP2P46087 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOP2P46087 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOP2P46087 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOP2P46087 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP2P46087 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP2P46087 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP2P46087 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP2P46087 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP2P46087 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP2P46087 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOP2P46087 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP2P46087 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP2P46087 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP2P46087 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP2P46087 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP2P46087 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP2P46087 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP2P46087 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP2P46087 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP2P46087 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP2P46087 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP2P46087 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP2P46087 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP2P46087 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP2P46087 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP2P46087 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP2P46087 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP2P46087 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP2P46087 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms