Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 TIP20YGL145W 2106 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 SSY5YJL156C 2100 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 MMP1YLL061W 1752 nt5.14□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YBR139WYBR139W 1527 nt5.13□□□□□ -1.59
SEC28P40509 MSC7YHR039C 1935 nt5.13□□□□□ -1.59
SEC28P40509 RIM15YFL033C 5313 nt5.13□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YJL068CYJL068C 900 nt5.13□□□□□ -1.59
SEC28P40509 SYN8YAL014C 768 nt5.13□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YLR194CYLR194C 765 nt5.13□□□□□ -1.59
SEC28P40509 CWC25YNL245C 540 nt5.13□□□□□ -1.59
SEC28P40509 RPL21BYPL079W 483 nt5.13□□□□□ -1.59
SEC28P40509 PMT5YDL093W 2232 nt5.12□□□□□ -1.59
SEC28P40509 MKS1YNL076W 1755 nt5.12□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YER084WYER084W 387 nt5.12□□□□□ -1.59
SEC28P40509 NAG1YGR031C-A 492 nt5.12□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YGR182CYGR182C 354 nt5.12□□□□□ -1.59
SEC28P40509 GRE1YPL223C 507 nt5.12□□□□□ -1.59
SEC28P40509 DXO1YDR370C 1329 nt5.12□□□□□ -1.59
SEC28P40509 LDB17YDL146W 1476 nt5.12□□□□□ -1.59
SEC28P40509 BIT2YBR270C 1638 nt5.12□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YHR182WYHR182W 2358 nt5.11□□□□□ -1.59
SEC28P40509 GET3YDL100C 1065 nt5.11□□□□□ -1.59
SEC28P40509 MRPL4YLR439W 960 nt5.11□□□□□ -1.59
SEC28P40509 SCW10YMR305C 1170 nt5.11□□□□□ -1.59
SEC28P40509 PPG1YNR032W 1107 nt5.11□□□□□ -1.59
SEC28P40509 TRM8YDL201W 861 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 HXT7YDR342C 1713 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 HXT6YDR343C 1713 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 CNL1YDR357C 369 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YDR445CYDR445C 408 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 SCS2YER120W 735 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 SUA5YGL169W 1281 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YGR139WYGR139W 339 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 ADE3YGR204W 2841 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 MRPL24YMR193W 777 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 ARG8YOL140W 1272 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 SAM4YPL273W 978 nt5.1□□□□□ -1.59
SEC28P40509 UBP9YER098W 2265 nt5.09□□□□□ -1.59
SEC28P40509 CUE2YKL090W 1332 nt5.09□□□□□ -1.59
SEC28P40509 KNH1YDL049C 807 nt5.09□□□□□ -1.59
SEC28P40509 IWR1YDL115C 1062 nt5.09□□□□□ -1.59
SEC28P40509 YDL121CYDL121C 450 nt5.09□□□□□ -1.59
SEC28P40509 MHR1YDR296W 681 nt5.09□□□□□ -1.59
SEC28P40509 MLC1YGL106W 450 nt5.09□□□□□ -1.59
SEC28P40509 SKI8YGL213C 1194 nt5.09□□□□□ -1.59
SEC28P40509 UIP3YAR027W 708 nt5.09□□□□□ -1.59
SEC28P40509 THI21YPL258C 1656 nt5.08□□□□□ -1.6
SEC28P40509 HXT14YNL318C 1623 nt5.08□□□□□ -1.6
SEC28P40509 SPL2YHR136C 447 nt5.08□□□□□ -1.6
SEC28P40509 APJ1YNL077W 1587 nt5.08□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YJR015WYJR015W 1533 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 SLT2YHR030C 1455 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 ESF1YDR365C 1887 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 PRP43YGL120C 2304 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 TEA1YOR337W 2280 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 MGS1YNL218W 1764 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 GRE3YHR104W 984 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 NOC4YPR144C 1659 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 FAA3YIL009W 2085 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 PRR1YKL116C 1557 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 FZO1YBR179C 2568 nt5.07□□□□□ -1.6
SEC28P40509 GPR1YDL035C 2886 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 ARG4YHR018C 1392 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YDL109CYDL109C 1944 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 FUI1YBL042C 1920 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 AAD4YDL243C 990 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 DCI1YOR180C 816 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YOR289WYOR289W 756 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 SRB6YBR253W 366 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 GAL4YPL248C 2646 nt5.06□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YFR035CYFR035C 345 nt5.05□□□□□ -1.6
SEC28P40509 NIT2YJL126W 924 nt5.05□□□□□ -1.6
SEC28P40509 FUN19YAL034C 1242 nt5.05□□□□□ -1.6
SEC28P40509 KTI12YKL110C 942 nt5.05□□□□□ -1.6
SEC28P40509 RPL3YOR063W 1164 nt5.05□□□□□ -1.6
SEC28P40509 MRI1YPR118W 1236 nt5.05□□□□□ -1.6
SEC28P40509 SEO1YAL067C 1782 nt5.05□□□□□ -1.6
SEC28P40509 THP1YOL072W 1368 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 NOB1YOR056C 1380 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 NGR1YBR212W 2019 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 GCV1YDR019C 1203 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 SPO74YGL170C 1242 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YOL079WYOL079W 399 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 ETR1YBR026C 1143 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YPL062WYPL062W 405 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 MPH2YDL247W 1830 nt5.04□□□□□ -1.6
SEC28P40509 HXT4YHR092C 1731 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 SED4YCR067C 3198 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 STP4YDL048C 1473 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YEL028WYEL028W 462 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 SPO12YHR152W 522 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YHR214WYHR214W 612 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 RPS0BYLR048W 759 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YAR066WYAR066W 612 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 YBL029WYBL029W 1131 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 ETT1YOR051C 1239 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 PRE2YPR103W 864 nt5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.6 ms