Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLP35914 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLP35914 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms