Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX6P30041 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDX6P30041 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRDX6P30041 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDX6P30041 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms