Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF2E1P29083 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms