Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC5P28715 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC5P28715 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms