Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA1P22314 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA1P22314 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA1P22314 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA1P22314 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA1P22314 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA1P22314 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA1P22314 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA1P22314 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA1P22314 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA1P22314 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA1P22314 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA1P22314 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA1P22314 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA1P22314 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA1P22314 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA1P22314 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA1P22314 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA1P22314 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA1P22314 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA1P22314 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA1P22314 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA1P22314 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA1P22314 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA1P22314 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA1P22314 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA1P22314 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA1P22314 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA1P22314 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA1P22314 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA1P22314 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA1P22314 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA1P22314 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA1P22314 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA1P22314 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA1P22314 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA1P22314 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA1P22314 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA1P22314 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA1P22314 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA1P22314 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA1P22314 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA1P22314 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA1P22314 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA1P22314 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA1P22314 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBA1P22314 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA1P22314 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA1P22314 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA1P22314 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA1P22314 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA1P22314 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA1P22314 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA1P22314 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA1P22314 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA1P22314 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA1P22314 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA1P22314 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA1P22314 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA1P22314 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA1P22314 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA1P22314 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA1P22314 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA1P22314 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA1P22314 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA1P22314 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA1P22314 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA1P22314 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA1P22314 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA1P22314 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms