Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFXP16104 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFXP16104 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms