Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME1P15531 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME1P15531 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME1P15531 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME1P15531 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME1P15531 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME1P15531 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME1P15531 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME1P15531 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME1P15531 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME1P15531 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME1P15531 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME1P15531 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME1P15531 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME1P15531 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME1P15531 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NME1P15531 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME1P15531 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME1P15531 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME1P15531 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME1P15531 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME1P15531 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME1P15531 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms