Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF35P13682 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF35P13682 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF35P13682 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms