Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIPP01282 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIPP01282 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPP01282 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPP01282 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPP01282 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIPP01282 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VIPP01282 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPP01282 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPP01282 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPP01282 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPP01282 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPP01282 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIPP01282 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIPP01282 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIPP01282 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIPP01282 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPP01282 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPP01282 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPP01282 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPP01282 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPP01282 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPP01282 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPP01282 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIPP01282 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPP01282 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VIPP01282 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPP01282 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPP01282 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPP01282 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPP01282 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPP01282 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPP01282 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPP01282 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPP01282 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIPP01282 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIPP01282 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIPP01282 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms