Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCRIPO60506 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms