Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1GO43497 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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