Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP290O15078 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP290O15078 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP290O15078 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP290O15078 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP290O15078 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP290O15078 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP290O15078 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP290O15078 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP290O15078 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP290O15078 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP290O15078 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP290O15078 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP290O15078 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP290O15078 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP290O15078 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP290O15078 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP290O15078 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP290O15078 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP290O15078 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP290O15078 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP290O15078 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP290O15078 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP290O15078 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP290O15078 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP290O15078 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP290O15078 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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