Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DGG1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DGG1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DGG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DGG1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DGG1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DGG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4DGG1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DGG1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DGG1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DGG1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DGG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DGG1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DGG1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DGG1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4DGG1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4DGG1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DGG1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DGG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DGG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DGG1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DGG1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DGG1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DGG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DGG1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DGG1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DGG1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DGG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DGG1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DGG1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DGG1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DGG1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DGG1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
B4DGG1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4DGG1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DGG1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DGG1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DGG1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DGG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DGG1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DGG1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DGG1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DGG1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DGG1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DGG1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DGG1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DGG1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DGG1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms