Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM221AA4D161 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM221AA4D161 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM221AA4D161 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM221AA4D161 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM221AA4D161 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM221AA4D161 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM221AA4D161 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM221AA4D161 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM221AA4D161 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms