Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ARFGEF1Q9Y6D6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms