Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E6

PCDHB3, Protocadherin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB3Q9Y5E6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB3Q9Y5E6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB3Q9Y5E6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms