Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCOR1Q9UKL0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCOR1Q9UKL0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RCOR1Q9UKL0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCOR1Q9UKL0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms