Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TNIKQ9UKE5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
TNIKQ9UKE5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TNIKQ9UKE5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms