Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD3Q9UJU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD3Q9UJU5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms