Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CFDP1Q9UEE9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CFDP1Q9UEE9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFDP1Q9UEE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms