Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TMOD3Q9NYL9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD3Q9NYL9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
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