Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED17Q9NVC6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED17Q9NVC6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms