Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1B3Q9NPD5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms