Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZY0

NXF2, Nuclear RNA export factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF2Q9GZY0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NXF2Q9GZY0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NXF2Q9GZY0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NXF2Q9GZY0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms