Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP85Q9BW27 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms