Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGIP1Q9BQI5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SGIP1Q9BQI5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms