Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RETNLBQ9BQ08 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RETNLBQ9BQ08 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms