Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF2Q99496 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms