Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPATA13Q96N96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA13Q96N96 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms